На территории санатория Ейск расположен лечебно-диагностический корпус. Имеются собственные грязелечебница и бальнеолечебница. Здравница располагает хорошо оснащенными клиническо-диагностической и биохимической лабораториями, кабинетами различной направленности лечения. Внедрена методика сухого вытяжения с вибрацией для разгрузки позвоночника на аппарате «Ормед-профессионал», успешно применяется методика подводного горизонтального дозированного вытяжения позвоночника на аппарате «Акватракцион».
В санатории используются не только современнейшие технологии оздоровления и лечения, но и природные лечебные факторы - сероводородная и йодобромная минеральные воды, иловая грязь месторождения «Плес Глубокий» (Ханского озера), климатолечение, морские купания. Широко применяется спелеотерапия (аналог природных соляных пещер), гипокситерапия (горный воздух), озонотерапия, ароматерапия, лечение переменными низкочастотными магнитными полями, лечебный чай из трав. Комплексное лечение дает положительные результаты.