Лечебная база санатория Ай-Даниль считается лучшей среди санаториев Крыма с лечением. Четырехэтажный лечебный корпус с закрытым переходом в Главный корпус рассчитан на отпуск более 600 процедур в день. Диагностический блок представлен современной ультразвуковой установкой, клинико-биохимической лабораторией, кабинетом функциональных исследований с холтеровским мониторированием, ЭКГ и артериального давления.
Лечение проводится традиционными (гидротерапия, классическая физиотерапия, лазеротерапия, современный ингаляторий, грязелечение, массажи, озонотерапия и др.) и нетрадиционными (гирудотерапия, гидроколонотерапия, иглорефлексотерапия) методами. Санаторно-курортное лечение проходит в комплексе с климатолечением, составной частью которого являются аэротерапия, талассотерапия, гелиотерапия, рефлексотерапия.